Kötü yaşam tarzı seçimleri nedeniyle, belirli bir insanın vücudu sürekli kargaşa içindedir. Mikroplar, bakteriler ve yabancı maddeler bol olduğundan, çeşitli hücrelerin işleri giderek zorlaşır ve tehlikeli hale gelir. Bu kaotik ortamda olgunlaşan talihsizlerin bir kısmı olarak, Sekkekkyuu AA2153 ve Hakkekkyuu U-1196 görevlerini yerine getirmeye çabalıyor - bu, birçok hücre arkadaşının görevde hayatını kaybetmesi anlamına gelse bile.Ana hikayesinden çok farklı bir ortamda geçen Hataraku Saibou Black , hücrelerin vücut sağlığını korumaya çalışırken verdiği mücadeleyi tasvir ediyor. Ancak, insanın durumu kötüleşmeye devam ediyor ve bu çabaların somut bir şey olup olmayacağı hücrelere bağlı!